L’Afrique du Sud est entrée dans une nouvelle phase de la pandémie de COVID : ce que cela signifie

Les cas confirmés de SARS-CoV-2 ont augmenté en Afrique du Sud ces dernières semaines. Cela a été largement motivé par deux descendants, connus sous le nom de sous-lignées BA.4 et BA.5, de la variante Omicron identifiée pour la première fois en Afrique du Sud à la fin de l’année dernière.

Ce qui est remarquable à propos du pic le plus récent, c’est qu’il existe un certain nombre de différences entre ce que le pays connaît actuellement et les quatre premières vagues de COVID-19 en Afrique du Sud.

Tout d’abord, presque tous les Sud-Africains bénéficient désormais d’une certaine forme d’immunité. Cela est dû au fait d’avoir été exposé au virus, d’avoir été vacciné ou d’une combinaison des deux.

Deuxièmement, la résurgence actuelle n’a entraîné qu’une faible augmentation des hospitalisations. Et, jusqu’à présent, une très faible augmentation de la surmortalité.

Troisièmement, la résurgence actuelle est le résultat d’une sous-lignée du variant (Omicron) qui a provoqué la quatrième vague. Le passage à des renaissances axées sur la sous-lignée plutôt qu’à de nouvelles variantes annonce potentiellement un changement dans le schéma évolutif du virus et une décision de le rendre endémique.

Enfin, le pays a actuellement le niveau de restrictions le plus bas par rapport à toute période depuis le début de la pandémie.

Ces différences sont importantes car elles ont des implications importantes pour l’interprétation des tendances de la COVID-19 et la réponse associée. Ils montrent que l’Afrique du Sud semble être entrée dans une nouvelle phase de l’épidémie.

Dans cette nouvelle phase, le niveau élevé d’immunité de la population en Afrique du Sud signifie probablement qu’en l’absence d’une nouvelle variante plus grave, les futurs pics d’infections ne devraient pas entraîner de fortes augmentations des hospitalisations et des décès.

Il est donc de plus en plus difficile d’utiliser les mêmes définitions et d’interpréter les données de la même manière que pour les deux dernières années. Et cela signifie que le pays a besoin de nouvelles façons de surveiller les risques qui, à leur tour, éclaireront les politiques potentielles pour protéger le système de santé et atténuer les risques individuels.

Par exemple, les modèles actuels démontrent que dans un contexte comme l’Afrique du Sud avec des niveaux élevés d’immunité de la population, il est possible d’avoir une augmentation substantielle de la transmission qui ne submerge pas le système de santé, même sans mettre en place de nouvelles restrictions.

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Les tendances actuelles à court terme du nombre de cas et de la proportion de tests qui reviennent positifs suggèrent qu’il existe un niveau élevé de transmission du virus. Mais les changements dans les modèles de test au fil du temps signifient que ces chiffres ne sont plus directement comparables aux vagues précédentes.

Les données les plus récentes suggèrent également que le taux d’augmentation des nouveaux cas commence à ralentir. Au cours des prochaines semaines, nous pourrions voir un pic et une baisse des cas signalés et de la positivité des tests, comme nous nous sommes habitués à le voir, ou un plateau prolongé avec un niveau de transmission relativement élevé.

À l’avenir, nous nous attendons à ce que le nombre de cas augmente et diminue. Cependant, les pics et les creux de transmission seront moins dramatiques qu’auparavant. Et il est possible que les périodes de transmission élevée deviennent de nature saisonnière, comme on le voit avec d’autres virus respiratoires.

Les modèles exacts de transmission du SRAS-CoV-2 seront déterminés par une interaction complexe entre les influences saisonnières, l’évolution virale, le déclin de l’immunité contre l’infection (et peut-être la maladie) et les processus démographiques qui entraînent des changements à long terme dans la sensibilité de la population.

La disponibilité des vaccins et des doses de rappel, et les taux élevés d’infection dans la population à ce jour, signifieront que le nombre de cas signalés sera moins fiable en tant qu’indicateur du risque d’infection ou prédicteur des hospitalisations et des décès.

Ce qui importe maintenant, c’est de savoir s’il y a suffisamment de surveillance pour détecter les changements majeurs à temps pour réagir. Les changements pourraient inclure des augmentations de la gravité ou de la sensibilité de la maladie. Un tel suivi permettra de s’assurer que le système de santé du pays n’est pas submergé.

Il est également important que les gens aient suffisamment d’informations pour prendre des décisions pour se protéger. L’évaluation des facteurs de risque individuels informera également le comportement des personnes (comme l’utilisation de masques et la quantité de contacts avec les autres). Les personnes les plus à risque de maladie grave peuvent choisir d’éviter les situations à haut risque, en particulier lorsque la transmission est élevée.

L’important

Il n’existe pas de mesures parfaites pour surveiller la force de l’infection. Mais il existe plusieurs indicateurs qui peuvent être utiles.

Premièrement, la proportion de tests positifs est un indicateur précieux des tendances à court terme, les changements étant généralement corrélés à une transmission accrue ou réduite.

De même, les augmentations soutenues du nombre de cas, ou poussées, restent de bons indicateurs d’augmentations à court terme de la transmission car elles se concentrent sur des augmentations par rapport à des observations très récentes.

Cependant, à plus long terme, d’autres facteurs variables dans le temps entrent en jeu. Ceux-ci inclus:

Ces deux facteurs affectent la probabilité qu’une personne infectée par le SRAS-CoV-2 soit détectée et comptée comme un cas, modifiant la signification des nombres de cas signalés par rapport à la circulation sous-jacente du virus.

Enfin, les données sur la concentration de matériel génomique du SRAS-CoV-2 dans les eaux usées peuvent être utilisées pour évaluer les tendances de transmission au niveau communautaire. Le Conseil sud-africain de la recherche médicale fournit un tableau de bord montrant les tendances de la concentration d’ARN du SRAS-CoV-2 pour bon nombre des districts les plus peuplés du pays. Le NICD publie également des rapports hebdomadaires montrant les tendances à plus long terme et la répartition génomique des échantillons détectés et un tableau de bord interactif.

Tous ces indicateurs fournissent des informations utiles sur la trajectoire de transmission au niveau communautaire. Mais aucun d’entre eux ne se traduit par un risque individuel d’infection, un risque de maladie grave ou un risque de submerger le système de santé.

Le port de masques et le fait d’éviter les espaces intérieurs surpeuplés ou mal ventilés et les grands rassemblements peuvent continuer d’être des outils importants pour réduire le risque d’infection à des moments de transmission relativement élevée. De plus, la vaccination demeure l’outil le plus efficace pour réduire le risque de maladie grave au niveau individuel.

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